Eind september begon de taliban een offensief in Kunduz, waarbij ze belangrijke gebouwen innamen en honderden gevangenen uit de plaatselijke gevangenis bevrijdden. Het was de eerste grote verovering van de taliban sinds de groep in 2001 werd verdreven. Het offensief leidde tot hevige gevechten tussen de militanten en de overheidstroepen, die ondersteund werden door luchtaanvallen van de VS. Na dagen van hevige strijd namen de Afghaanse regeringstroepen de stad weer in.Amerikaanse gevechtsvliegtuigen voerden aanvallen uit op de taliban, maar in het begin van oktober werd ook een ziekenhuis van Artsen Zonder Grenzen geraakt, waarbij 22 medewerkers en patiënten omkwamen, en velen ernstig gewond raakten. Het Pentagon gaf later toe dat de aanval een fout was.VICE News-filmmaker Nagieb Khaja kreeg exclusieve toegang tot de taliban en ontmoette de militanten die Kunduz binnenvielen en kortstondig veroverden.